Organami Szkoły są:
- Dyrektor Szkoły,
- Rada Pedagogiczna,
- Rada Samorządu Uczniowskiego,
- Rada Rodziców.
Organem założycielskim i prowadzącym Szkołę jest Pałuckie Stowarzyszenie "Przyszłość".
Organem nadzoru pedagogicznego jest Kujawsko-Pomorski Kurator Oświaty w Bydgoszczy.